01月31日的《熱心腸日報》，我們解讀了 15 篇文獻，關註：促癌菌，胃癌，大腸癌，肝癌，咽峽炎鏈球菌，脆弱擬桿菌，消化鏈球菌，乙酸，合成群落，高脂飲食，疾病預測，菌群移植，囊性纖維化，Fractyl Health，恩沃利單抗註射液，內默斯醫學科學獎，愛科瑞思，Infinite Roots。
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於君 沈祖堯Cell：咽峽炎鏈球菌——新的促胃癌菌
Cell——[64.5]
① 香港中文大學於君和沈祖堯與團隊鑒定出幽門螺桿菌以外的一種新的促胃癌菌——咽峽炎鏈球菌（Sa）；② Sa在胃癌患者的胃黏膜中富集；③ 小鼠中，Sa可在胃中定植並引起急性胃炎，Sa長期感染可自發誘導慢性胃炎→胃萎縮→組織化生→異型增生的癌前病變，並在多種小鼠胃癌模型中加速胃腫瘤發生，伴隨對胃屏障功能和胃菌群的破壞，同時促進細胞增殖、抑制細胞凋亡；④ 機制上，Sa的表面蛋白TMPC可與胃上皮細胞的Annexin A2（ANXA2）受體結合，這種互作促進了Sa的附著和定植，並激活胃組織中的致癌MAPK信號；⑤ 總之，該研究表明Sa是一種通過與胃上皮細胞直接互作、經TMPC-ANXA2-MAPK軸促進胃腫瘤發生的病原體，為胃癌病因學研究提供了新視角。
【原文信息】
Streptococcus anginosus promotes gastric inflammation, atrophy, and tumorigenesis in mice
2024-01-30 , doi: 10.1016/j.cell.2024.01.004
產毒素脆弱擬桿菌促進大腸癌惡性發展
Clinical Microbiology and Infection——[14.2]
① 該研究通過大量結直腸癌臨床樣本的檢測發現，脆弱擬桿菌（BF）和其產毒素基因（ETBF）的DNA含量與CIMP高、BRAF突變和MSI高型結腸癌呈正相關，支持其結直腸癌發病中的重要作用；② 分析了1232個結腸癌樣本，在高CIMP、BARF突變和高MSI高結腸癌亞型中發現伴隨有高水平的BF和ETBF；③ 高BF針對高CIMP、高MSI和BRAF突變結腸癌亞型的多變量校正比值比（OR）分別為1.4、2.14和1.02；④ 高ETBF針對高CIMP、BRAF突變和高MSI的OR分別為2.0、2.86和1.09；⑤ 但BF和ETBF與結腸癌特異性和結腸癌總體生存率相關性不強；⑥ 該研究結果提示BF豐度與高CIMP和高MSI結腸癌相關，ETBF豐度與高CIMP和BRAF突變結腸癌相關，這些結果為深入理解結直腸癌的發病機制提供了重要線索。
【原文信息】
Enrichment of Bacteroides fragilis and enterotoxigenic Bacteroides fragilis in CpG island methylator phenotype (CIMP)-high colorectal carcinoma
2024-01-22 , doi: 10.1016/j.cmi.2024.01.013
厭氧消化鏈球菌的代謝物抑制鐵死亡，促腸癌
Cancer Research——[11.2]
① 該研究揭示腸道中的厭氧消化鏈球菌代謝產物反式-3-吲哚丙烯酸（IDA）如何影響結直腸癌（CRC）；② IDA通過激活芳烴受體AHR促進乙醛脫氫酶1傢族成員A3（ALDH1A3）表達，從而抑制鐵死亡；③ ALDH1A3通過產生NADH促進還原型輔酶COQH10的合成，進而抵抗鐵死亡；④ 敲除AHR、AIFM2或ALDH1A3可逆轉IDA對鐵死亡的抑制作用；⑤ CRC患者中富集厭氧消化鏈球菌；⑥ 補充IDA或厭氧消化鏈球菌可加速小鼠CRC進展；⑦ 該研究為針對厭氧消化鏈球菌介導的鐵死亡抵抗提供了新的對抗CRC發展的策略。
【原文信息】
Gut microbiome mediates ferroptosis resistance for colorectal cancer development
2024-01-26 , doi: 10.1158/0008-5472.CAN-24-0275
國內團隊：多形擬桿菌衍生的乙酸可抑制肝細胞癌
Gut Microbes——[12.2]
① 溫州醫科大學附屬衢州醫院的袁磊、海軍醫科大學的Li Yong和馮飛靈與團隊發表文章，發現多形擬桿菌衍生的乙酸可能調節肝細胞癌（HCC）免疫微環境，促進細胞毒性CD8 T細胞功能，並通過影響脂肪酸代謝和組蛋白乙酰化修飾抑制HCC的發展；② 多形擬桿菌衍生的乙酸調控促炎性巨噬細胞的極化，促進細胞毒性CD8 T細胞的功能；③ 乙酸通過對ACC1（脂肪酸生物合成的關鍵酶）啟動子區域進行組蛋白乙酰化修飾，增加其轉錄，而脂肪酸生物合成參與調控促炎性細胞的極化；④ 組蛋白乙酰化修飾抑制劑薑黃素顯著阻斷多形擬桿菌和乙酸對HCC腫瘤生長的抑制作用；⑤ 研究揭示了腸道菌群衍生的乙酸在HCC復發和患者臨床結果中的潛在作用，為通過靶向腸道菌群及其代謝產物開發新的HCC預防和治療策略提供了見解。
【原文信息】
B. thetaiotaomicron-derived acetic acid modulate immune microenvironment and tumor growth in hepatocellular carcinoma
2024-01-25 , doi: 10.1080/19490976.2023.2297846
蘭大團隊：編程化合成菌株群落靶向治療大腸癌
NPJ Biofilms and Microbiomes——[9.2]
① 基於益生菌的抗癌療法仍面臨滲透性、靶向性和劑量等問題，蘭州大學李祥鍇和韓華雯團隊基於腫瘤微環境的低pH、高乳酸和缺氧條件，設計了三種條件激活的編程化Nissle 1917（EcN）用於表達溶血毒素殺傷腫瘤；② 在體外驗證擬合了三種環境信號對編程化EcN的誘導效果，並驗證了誘導後菌株對腫瘤細胞的殺傷效果；③ CT26皮下瘤小鼠模型使用編程化EcN治療後，誘導型EcN表現出良好抑瘤效果，且小鼠體重得以維持；④ 將三種誘導啟動子菌株作為合成菌株群落（SynCon）治療DSS/AOM聯合誘導結腸癌小鼠，菌株加入傳感模塊和XOR開關，多傳感模塊SynCon顯著增長結直腸長度、減少息肉數量；⑤ SynCon通過增加丁酸生產者Lactobacillaceae NK4A136豐度，降低結腸炎相關擬桿菌豐度調節菌群。
【原文信息】
Enhancing tumor-specific recognition of programmable synthetic bacterial consortium for precision therapy of colorectal cancer
2024-01-20 , doi: 10.1038/s41522-024-00479-8
國內團隊：高脂飲食促腸癌，腸菌或是罪魁禍首
NPJ Biofilms and Microbiomes——[9.2]
① 四川大學華西醫院的畢鋒團隊發表文章，發現高脂飲食導致紅蝽菌科在結腸中富集，且分離其中一種內源菌株Cori.ST1911可促進CRC的發生和發展，為預防和治療CRC提供了新的腸道菌群幹預策略；② 高脂飲食小鼠中，紅蝽菌科結腸中豐度增加；③ 成功從HFD小鼠的糞便中分離和培養了一種內源性紅蝽菌科菌株，命名為Cori.ST1911，驗證了其在幾種CRC小鼠模型中的致瘤潛能；④ 通過將CRC細胞系和類器官與Cori.ST1911共培養，發現Cori.ST1911通過激活CPT1A增加了酰基肉堿水平，證明了CPT1A-ERK信號通路參與Cori.ST1911對CRC發生發展的影響；⑤ 內源乳酸菌株La.mu730可以幹擾Cori.ST1911的定植並恢復腸道屏障功能。
【原文信息】
Endogenous Coriobacteriaceae enriched by a high-fat diet promotes colorectal tumorigenesis through the CPT1A-ERK axis
2024-01-20 , doi: 10.1038/s41522-023-00472-7
人體微生物組：疾病預測與調控（綜述）
Trends in Microbiology——[15.9]
① 這篇綜述主要回顧了人類微生物組在疾病預測中的研究，尤其是前瞻性研究以及調控微生物組作為治療策略；② 微生物組的結構和變化與健康密切相關，受遺傳、飲食、藥物等諸多環境和宿主因素的影響；③ 疾病下的微生物組變化與疾病風險有關，越來越多的研究將微生物組納入基於機器學習的疾病預測模型以改善預測效果，尤其在肝病、呼吸系統疾病、糖尿病、炎癥性腸病和神經精神疾病等疾病中具有前景；④ 腸道微生物組參與調節藥物治療效果和不良反應，通過菌群移植等手段調節微生物組可作為疾病治療策略，多組學分析可揭示復雜疾病的異質性；⑤ 如何準確地定義和檢測微生物、如何減少技術偏差等問題，是該領域面臨的挑戰。
【原文信息】
Harnessing human microbiomes for disease prediction
2024-01-20 , doi: 10.1016/j.tim.2023.12.004
想要疾病預測模型更準確？試試整合表型變量和腸道菌群
Gut Microbes——[12.2]
① 本研究為單中心橫斷面病例對照研究，招募了50名健康對照者和152名患有各種疾病的個體進行表型變量（PV）和腸道菌群（GM）組成的評估，發現在所有疾病中，當GM和PV數據被整合時，模型表現出最佳性能；② GM的預測潛力因疾病而異，部分自身免疫相關疾病表現較弱，包括類風濕性關節炎、潰瘍性結腸炎和系統性紅斑狼瘡；③ GM在預測克羅恩病和斑塊狀銀屑病表現出稍好的預測性能，在預測糖尿病（1型和2型）方面表現出更高的準確性；④ 在預測模型中加入PV顯著提高了模型對所有疾病的準確性；⑤ 綜上所述，僅依靠微生物標志物來預測健康結果的有效性是有限的，將PV與GM數據相結合會產生一個增強的預測模型，從而提高健康結果的可預測性。
【原文信息】
Evaluation of gut microbiota predictive potential associated with phenotypic characteristics to identify multifactorial diseases
2024-01-18 , doi: 10.1080/19490976.2023.2297815
腸菌移植治療疾病的機制剖析（綜述）
Trends in Molecular Medicine——[13.6]
① 本綜述探討了腸菌移植（FMT）在微生物組相關疾病中的療效機制，發現其療效可能與有針對性恢復微生物功能網絡有關，而非傳統的微生物組失調；② FMT的作用機制可能適用於反復發作的難治性艱難梭菌感染、炎癥性腸病、代謝性疾病和癌癥，其中機制是基於恢復失調菌群功能或調節宿主免疫、腸屏障；③ FMT後未表現出良好療效可能是菌群未成功重塑或供體菌群中缺乏關鍵組分，因此嚴格的供體選擇標準（供體飲食、生活方式）、制備和給藥方法、以及理解各種糞便成分對疾病治療效果的影響將有助於FMT靶向治療的臨床結果；④ 同時考慮供體的遺傳背景和其他環境因素，理解供體特征與特定疾病的關系，將有助於開展個性化FMT療法。
【原文信息】
Dissecting mechanisms of fecal microbiota transplantation efficacy in disease
2024-01-08 , doi: 10.1016/j.molmed.2023.12.005
Cell子刊：囊性纖維化管理中微生物組療法的潛力（綜述）
Cell Reports Medicine——[14.3]
① 本綜述總結了囊性纖維化（CF）治療中抗生素和CFTR調節劑的局限性，並探討了微生物組療法在預防CF相關感染中的潛在作用；② CF患者與健康人的呼吸道菌群存在顯著差異，其中不僅是特定病原體如銅綠的出現，還伴隨有益共生菌豐度的降低，同時真菌與病毒感染也與呼吸道菌群紊亂相關；③ 抗生素存在抗生素耐藥性和氣道微生物組紊亂問題，而CFTR調節劑的普及性不足，且仍存在結構性肺損傷和病原體過度生長；④ 口服益生菌對呼吸道系統的益處包括可改善肺功能、減少氣道感染和阻止病程加重，但同時可能有最小不良反應如輕微脹氣出現；⑤ 此外最新數據表明，局部使用益生菌可能是預防下呼吸道病原體過度生長的更有針對性的方法，但也仍存最佳給藥時機、吸入方式、給藥量和持續時間等技術障礙和安全性考量。
【原文信息】
Positioning the preventive potential of microbiome treatments for cystic fibrosis in the context of current therapies
2024-01-16 , doi: 10.1016/j.xcrm.2023.101371
代謝治療公司Fractyl Health擬IPO籌集1億美元
① 近日，生物技術公司Fractyl Health宣佈向美國證券交易委員會提交首次公開募股（IPO）申請，並計劃籌集1億美元；② IPO籌集資金將用於推進其臨床研究活動和維持日常運營；③ Fractyl Health公司開發了門診程序治療Revita DMR系統和胰腺基因治療平臺Rejuva；④ Revita DMR系統旨在持久改善十二指腸功能障礙，該系統已在歐洲獲批用於治療控制不良的2型糖尿病患者；⑤ Rejuva是一種新型局部應用的、腺相關病毒傳遞的胰腺基因治療平臺，旨在幫助肥胖患者控制體重。
【原文信息】
融資1億美元！減肥藥biotech擬IPO
2024-01-30 , 生物藥大時代
康寧傑瑞/思路迪醫藥與Glenmark就恩沃利單抗達成授權協議
① 1月25日，康寧傑瑞與思路迪醫藥共同宣佈，雙方就恩沃利單抗註射液與Glenmark公司達成協議；② 協議授予Glenmark公司在印度、亞太地區和中東等地恩沃利單抗註射液腫瘤適應證的開發和商業化獨傢許可權益；③ 康寧傑瑞與思路迪醫藥將向Glenmark公司收取包含首付款和裡程碑付款在內的7.008億美元費用，以及凈銷售額提成；④ 2021年，恩沃利單抗正式在中國率先獲批上市，適用治療晚期結直腸癌和其它晚期實體瘤患者。
【原文信息】
康寧傑瑞與思路迪醫藥、Glenmark就KN035達成授權許可協議
2024-01-25 , 康寧傑瑞
Jeffrey Gordon獲2024年內默斯醫學科學獎
① 近日，微生物組之父聖路易斯華盛頓大學Jeffrey Gordon教授獲得了2024年內默斯醫學科學獎，獎金為35萬美元；② Jeffrey Gordon教授在腸道菌群領域取得了突破性成就，研究成果包括發現與兒童營養不良相關的細菌菌株，以及開發改善腸道菌群的營養食品；③ 內默斯獎由美國西北大學設立，分設醫學獎、經濟學獎、數學獎、作曲獎和地球科學獎，該獎項每隔一年頒發一次，旨在表彰在本領域做出突出貢獻的專業人士。
【原文信息】
‘Father of Microbiome Research’ Awarded 2024 Nemmers Prize in Medical Science
2024-01-18 , Northwestern Medicine
愛科瑞思註射用ACR246臨床申請獲批
① 1月26日，愛科瑞思生物醫藥有限公司宣佈，旗下註射用ACR246 1/2a期臨床試驗申請獲得國傢藥監局批準；② ACR246擬定適應證為晚期實體瘤，包括不限於食管癌、結直腸癌、胃癌和非小細胞肺癌等；③ ACR246是一款以5T4為靶點的抗體偶聯藥物（ADC），具有循環系統穩定、靶向腫瘤組織和胞內釋放的特點；④ 患者入組給藥預計於2024年一季度開始，ACR246有望成為全球首個上市的抗5T4靶點類ADC新藥。
【原文信息】
愛科瑞思ACR246臨床申請獲批
2024-01-29 , 愛科瑞思
替代蛋白公司Infinite Roots獲得5800萬美元融資
① 近日，德國生物技術公司Infinite Roots宣佈完成5800萬美元（約合人民幣4.2億元）的B輪融資；② Dr Hans Riegel Holding領銜了本輪投資，REWE集團和Betagro Ventures等參投，資金將用於擴大Infinite Roots發酵產能以及擴大商業版圖；③ Infinite Roots專註於利用生物質發酵來培育富含微量營養素、鮮味十足的蘑菇菌絲體，以供開發肉類和乳制品類似物等；④ 據悉，Infinite Roots計劃於2024年年內上市。
【原文信息】
Infinite Roots raises $58M in Europe's largest mycelium investment
2024-01-25 , Tech EU
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