三世達賴在河套地區的弘法，讓格魯派信仰首次紮根大漠南北。火落赤和真相台吉東遷後，第一次將蒙古右翼的牧場推進至「青海河套」，直接威脅着明朝隴原、河湟的安全。「順義王」扯力克的西行，讓韃靼青海部持續東擴，製造了震驚明廷的「河洮事件」。鄭洛大軍雖在短時間內撲滅了韃靼青海部的反叛，但並未撼動青海蒙古諸部的根基。 隨着挑釁的持續升級，明軍再度西征「海寇」，先後在甘州、西寧衛南川和西川取得三次大勝，並以武力收復了扼守蒙青烏鞘嶺通道的「松寇」。蒙古貴族出身的四世達賴，在韃靼軍隊的護送下，成功前往拉薩坐床，格魯派與漠南蒙古勢力的聯絡得以延續。